Basic認証で2度認証が生じるので、1度にしたい

さくらの共有サーバーを借りて、独自ドメインでサイトを運用しています。 そのサイトにBasic認証を設定したところ、独自ドメインとさくらドメインとで2度認証が求められました。 1度の認証で済むように設定することは可能でしょうか？ 因みに、独自、さくらの順で求められます。 なお、さくらの認証はキャンセルしてもサイトはIEでは表示され、 ChromeではCSSが利いていないかたちで表示されます。